Base historique de Terre de Liens, l’association nationale (devenue Fédération) a été créée en 2003 pour concrétiser les idées de ses fondateurs : libérer la terre de la spéculation foncière, favoriser l’accès des paysans à la terre, promouvoir des projets citoyens pour dynamiser les territoires ruraux et appuyer une agriculture respectueuse de l’environnement.
Elle a également porté et accompagné le déploiement des structures qui composent aujourd’hui le mouvement : la Foncière, la Fondation et les associations dans l'ensemble des régions de France.
Depuis 2015, la Fédération Terre de Liens est reconnue Organisme national à vocation agricole et rural (ONVAR) par le ministère de l’Agriculture. Cela rend le mouvement acteur de la politique nationale en la matière.
Terre de Liens travaille étroitement avec InPACT (Initiative pour une agriculture citoyenne et territoriale), réseau de 10 organisations promouvant une alternative au système agricole actuel.